近期,完美生科院自主研发的二代转录组测序数据分析软件“TransAnalyzer”成功获得国家软件著作权证书。
这是继前两款软件 (点击查看) 之后,生科院获得的第三个自主研发软件的软著证书,标志着生科院在生物信息学分析领域取得了新的突破,为后续科研和产品开发提供了强有力的技术支持。
软著证书
转录组(Transcriptome)广义上指细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA等。作为基因表达的中间产物,转录组不仅搭建了基因组与蛋白质组之间的桥梁,更是生命活动调控网络中不可或缺的一环。
转录组学关注的是基因转录成RNA的过程以及转录后的调控机制,即基因表达的“第一步”及其后续调控。通过转录组,完美可以揭示基因表达调控的整体特征,发现生物学过程相关的分子作用机理,以及查找具有特殊功能的基因。
转录组测序(RNA-seq)技术的出现,为转录组学研究带来了革命性的突破。这一基于高通量测序的方法,能够系统地解析细胞或组织中的转录产物,全面揭示基因转录水平的微妙变化,并绘制出复杂的生物学通路与性状调控网络的精细图谱。
转录组测序技术[1]
近日,瑞典卡罗琳医学院宣布了一项令人瞩目的决定:将2024年诺贝尔生理学或医学奖的殊荣授予维克托·安布罗斯 (Victor Ambros) 教授与加里·鲁夫昆 (Gary Ruvkun) 教授,以表彰他们在microRNA (miRNA) 领域的开创性发现及其对转录后基因调控机制的深刻洞察。
miRNA作为转录组中的一类非编码RNA,通过转录组测序技术的精确捕获及转录组学分析,得以在细胞的微观层面展现其调控基因的神奇作用,为非编码区域的功能研究开辟了全新的视野。
来源:诺贝尔奖官方
转录组学研究的精髓在于其能够敏锐地捕捉到转录组随着环境条件、生物体发育阶段以及不同组织与细胞间的差异所展现出的动态变化。
无论是成熟线虫与幼虫之间的差异,还是药物干预前后细胞状态的显著转变,转录组都以其独特的方式记录并反映这些变化。通过分析在特定时间与特定条件下细胞内所有转录本的差异表达信息,转录组学得以全面揭示基因表达调控的整体特征,深入剖析了基因表达水平的动态波动以及基因调控网络的复杂性与灵活性。
因此,转录组学不仅是理解生命现象的重要工具,更是探索基因功能、解析生物体适应机制及疾病发生发展的关键途径。
在保健食品与化妆品研发领域,转录组学技术成为革新动力,为产品开拓了新的研发路径与可能性。
健康食品领域
转录组学技术可以深入探索生物活性化合物与实现膳食营养功能相关的基因,揭示食品中生物活性化合物对人体健康的潜在效益,从而推动新型保健食品的创新与开发。
例如,完美运用转录组学和代谢组学技术成功揭示了“桑叶沙棘蛋白肽”促进大鼠体重减轻以及改善非酒精性脂肪肝的机制。
化妆品领域
借助转录组学技术,完美可以对化妆品原料的功效及其相关分子机制进行全面分析,深度挖掘原料的潜在功效,为化妆品新产品的开发提供坚实的科学理论依据。
产品安全性评估
保健食品和化妆品中的活性成分可影响细胞基因表达调控。
转录组学分析能够剖析这些成分的作用机制,筛选有效成分,并进行安全性评估,确保产品在实际应用中的安全可靠性。
为了更高效、准确地解读和分析转录组测序产生的海量数据,生科院生物信息学团队开发了分析软件“TransAnalyzer”,具备以下特点和性能:
√ 先进算法与最新数据库:
软件结合了稳定先进的算法和最新数据库,为研究人员提供了强大的数据分析支持。
√ 全流程集成:
能够完成原始下机数据的质量控制、转录本比对、差异基因注释以及基因功能注释等全面分析。
√ 准确性和可靠性:
通过与多家第三方实验室比对,软件的准确性和可靠性得到了充分证明。
√高效批量处理:
软件已部署于完美生物信息学专用高性能服务器集群上,可实现成百上千个原始数据的批量分析,极大地提高了分析效率。
此次“TransAnalyzer”软件的成功研发并获得软著证书,是完美生科院在生物信息学领域取得的又一重要成果。
该软件将为保健食品和化妆品的研发提供更为科学、准确的数据支持,助力提升产品效能。未来,生科院将继续秉承创新精神,不断深化转录组测序技术的研究与应用,为科学研究赋能产品打下更坚实的基础。
相信在不久的将来,更多具有创新性和实用性的科研成果将从生科院诞生,为人类健康和美丽事业贡献更多力量。
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